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Wir sind Ansprechpartner*innen für Technologien im Bereich der Genom- und Transkriptomforschung. Als 10x Genomics Serviceprovider bieten wir schwerpunktmäßig Einzelzell und (in-situ) -Spatial Transkriptomanalysen an. Ein weiterer Fokus ist die Herstellung von Next Generation Sequencing (NGS) Libraries für die Bulk-RNA Sequenzierung und Mikrobiomanalysen. Je nach Protokoll, Probenart und Anzahl können Proben vollautomatisiert oder manuell abgearbeitet werden.

Die Etablierung von Protokollen und Methoden gehört ebenfalls zu unserem Leistungsspektrum (abhängig von Personal- und Laborressourcen).

Kontaktiere uns, um mehr über unsere Leistungen zu erfahren oder um dein Projekt zu besprechen.

Managing Directors

Birgit Gallé & Nina Schweintzger 
T: +43 316 385 72828
T: +43 316 385 72830

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News

  • !NEU! Xenium Protein Immunologie Panels sind am Markt und können bestellt werden!
  • !NEU! Lexogen QuantSeq3' mRNA Seq Library Prep kit mit UDI ist etabliert!
  • !NEU! Visium HD jetzt verfügbar!
  • 10x FLEX Protokoll: scRNAseq für FFPE und fixiertes Material!
  • FFPE bulk RNA seq etabliert

 

 

Save the dates:

28.08.2025: Part 2/3 Xenium Workflow

24./25.09.2025: Cross-Plattform Synergy scRNAseq and Xenium Spatial transcriptomics (nähere Infos folgen)

02.10.2025: OLINK Lunch Seminar (nähere Infos folgen)

10.11 - 13.11.25: Real-time PCR Workshop

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Protokoll- und Methodenetablierungen

  • Transkriptomuntersuchung aus extrazellulären Vesikeln. Status: in Bearbeitung
  • Nanopore Mikrobiom Ligationprotocol. Status: in Bearbeitung
  • Automatisierte RNA-Extraktion aus FFPE. Status: in Bearbeitung

 

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Kooperationspartner*innen

Unsere Technologien erfordern die multidisziplinäre Expertise der am ZMF vorhandenen Core Facilities und anderer Kooperationspartner*innen.

Core Facilities des ZMF

  • Core Facility Computational Bioanalytics
  • Core Facility Bioimaging & Flow Cytometry
     

Core Facility der Biomedizinischen Forschung

  • Alternative Biomodels and Preclinical Imaging
     

Vienna BioCenter Core Facilities

  • Core Facility Next Generation Sequencing
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Automatisierte Pipelines

  • QiaSymphony: DNA/RNA Extraktion mit 24 Proben/Lauf (3 x 24 Proben am Tag)
  • Biomek i7: NGS Library Präparation bis zu 96 Proben pro Lauf (min. 48 Proben)
  • RNA angereicherte bulk RNA seq
  • rRNA depletierte bulk RNA seq
  • Metagenom