ZMF

Die Core Facility Molecular Biology (CFMB)bietet moderne Technologien zur Genom- und Transkriptomanalytik an, wobei der Fokus auf Next Generation Sequencing (NGS) basierten Applikationen liegt. Die hochwertige Probenvorbereitung durch den Einsatz von teil/-vollautomatisierten Pipettiersystemen garantiert standardisierte Arbeitsprozesse und reproduzierbare Ergebnisse.

Labor

Service

  • Automatisierte Nucleinsäure-Extraktion
  • Automatisierte Herstellung von Sequenzierbibliotheken für Transkriptomanalytik
  • 16S/18S/ITS basierte Microbiomanalyse
  • Shot gun Metagenom und Shallow Sequenzierung
  • 10X Genomics basierte Einzellzellanalytik (Transkriptom, Immunprofiling, Oberflächenproteinsignatur, ATAC)
  • VISIUM Spatial Transcriptomics (Protokolle für Cryo- und FFPE Material)
  • NGS basiertes CRISPR Screening
  • Quantitative Real-time PCR
  • Digital Droplet PCR
  • Nanostring basierte Analysen (mRNA, miRNA, PlexSet)

Infrastruktur

  • QiaSymphony (Qiagen)
  • Biomek i7 (Beckman)
  • MiSeq (Illumina)
  • Chromium Controller (10X Genomics)
  • Digital Droplet Generator (BioRad)
  • nCounter Prepstation (Nanostring)
  • LC480 Real-time PCR System für 96 und 384 Well-Format (Roche)
  • CFX Touch Real-time PCR System für 96 und 384 Well-Format (BioRad)

Kontakt

Mag.a Dr.in
Birgit Gallé 
T: +43 316 385 72828

Nina Schweintzger MSc PhD
T: +43 316 385 30899
T: +43 316 385 72830